特発性肺線維症におけるマイクロバイオームとバイロームの役割

The role of microbiome and virome in idiopathic pulmonary fibrosis

P Ntolios, V Tzilas, E Bouros, E Avdoula… - Biomedicines, 2021 - mdpi.com

… incidence of both sporadic and familial IPF [16,17]. In this review, we summarize the available
evidence regarding the lung microbiome in IPF patients, the available data regarding its …

The Role of Microbiome and Virome in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Abstract
The interest in the lung microbiome and virome and their contribution to the pathogenesis, perpetuation and progression of idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) has been increasing during the last decade. The utilization of high-throughput sequencing to detect microbial and/or viral genetic material in bronchoalveolar lavage fluid or lung tissue samples has amplified the ability to identify and quantify specific microbial and viral populations. In stable IPF, higher microbial burden is associated with worse prognosis but no specific microbe has been identified to contribute to this. Additionally, no causative relation has been established. Regarding viral infections, although in the past they have been associated with IPF, causation has not been proved. Although in the past the diagnosis of acute exacerbation of IPF (AE-IPF) was not considered in patients with overt infection, this was amended in the last few years and infection is considered a cause for exacerbation. Besides this, a higher microbial burden has been found in the lungs of patients with AE-IPF and an association with higher morbidity and mortality has been confirmed. In contrast, an association of AE-IPF with viral infection has not been established. Despite the progress during the last decade, a comprehensive knowledge of the microbiome and virome in IPF and their role in disease pathogenesis are yet elusive. Although association with disease severity, risk for progression and mortality has been established, causation has not been proven and the potential use as a biomarker or the benefits of antimicrobial therapeutic strategies are yet to be determined.
特発性肺線維症におけるマイクロバイオームとバイロームの役割
概要
肺のマイクロバイオームとバイロームへの関心、および特発性肺線維症 (IPF) の病因、永続化、および進行へのそれらの寄与は、過去 10 年間で増加しています。気管支肺胞洗浄液または肺組織サンプル中の微生物および/またはウイルスの遺伝物質を検出するためのハイスループットシーケンシングの利用により、特定の微生物およびウイルス集団を識別および定量化する能力が増幅されました。安定した IPF では、微生物量が多いほど予後が悪化しますが、これに寄与する特定の微生物は特定されていません。また、因果関係は確立されていません。ウイルス感染症については、過去にIPFとの関連が指摘されていましたが、因果関係は証明されていません。以前は明らかな感染症の患者では IPF の急性増悪 (AE-IPF) の診断は考慮されていませんでしたが、これはここ数年で修正され、感染は増悪の原因であると考えられています。これに加えて、AE-IPF患者の肺ではより高い微生物量が発見されており、より高い罹患率と死亡率との関連が確認されています。対照的に、AE-IPF とウイルス感染との関連は確立されていません。過去 10 年間の進歩にもかかわらず、IPF におけるマイクロバイオームとバイローム、および疾患の病因におけるそれらの役割に関する包括的な知識はまだとらえどころのないものです。疾患の重症度、進行および死亡のリスクとの関連性は確立されていますが、因果関係は証明されておらず、バイオマーカーとしての潜在的な使用または抗菌治療戦略の利点はまだ決定されていません.