ChatGPTのプロンプトエンジニアリングの専門家とまでは言えないまでも、AI使いとして一定レベル仕事をこなしています。並行して、医療統計の方も専門家とは言えない間でも、開発担当者に教えられるレベルにはなりました。元々、統計学には大学1年の頃から今までもう何十年も、ずっとお世話になってきたので、副専攻レベルではありました。病気で失われた機能を補うのを十分超えるレベルでAI武装して、バイオ・医薬 x ベンチャー・キャピタル x デジタル・AI・統計をブランドとしていけば、未来は明るい！夜が来れば必ず朝が来る。
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Abstract
Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a progressive, irreversible, and rapidly fatal interstitial lung disease marked by the replacement of lung alveoli with dense fibrotic matrices. Although the mechanisms initiating IPF remain unclear, rare and common alleles of genes expressed in lung epithelia, combined with aging, contribute to the risk for this condition. Consistently, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) studies have identified lung basal cell heterogeneity in IPF that might be pathogenic. We used single-cell cloning technologies to generate “libraries” of basal stem cells from the distal lungs of 16 patients with IPF and 10 controls. We identified a major stem cell variant that was distinguished from normal stem cells by its ability to transform normal lung fibroblasts into pathogenic myofibroblasts in vitro and to activate and recruit myofibroblasts in clonal xenografts. This profibrotic stem cell variant, which was shown to preexist in low quantities in normal and even fetal lungs, expressed a broad network of genes implicated in organ fibrosis and showed overlap in gene expression with abnormal epithelial signatures identified in previously published scRNA-seq studies of IPF. Drug screens highlighted specific vulnerabilities of this profibrotic variant to inhibitors of epidermal growth factor and mammalian target of rapamycin signaling as prospective therapeutic targets. This profibrotic stem cell variant in IPF was distinct from recently identified profibrotic stem cell variants in chronic obstructive pulmonary disease and may extend the notion that inappropriate accrual of minor and preexisting stem cell variants contributes to chronic lung conditions.
概要
特発性肺線維症における線維化促進性幹細胞変異体のクローニング：
簡単な概要
特発性肺線維症（IPF）は、肺胞が高密度の線維性マトリックスに置き換わることを特徴とする、進行性、不可逆性、急速に致死性の間質性肺疾患である。 IPFを引き起こすメカニズムはまだ不明であるが、肺上皮で発現される遺伝子のまれで一般的な対立遺伝子と老化が組み合わさって、この状態のリスクに寄与する。 一貫して、単一細胞RNA配列（scRNA-seq）研究により、病原性の可能性があるIPFにおける肺基底細胞の不均一性が同定されている。 我々は、単一細胞クローニング技術を使用して、16人のIPF患者と10人の対照の遠位肺から基底幹細胞の「ライブラリー」を作成した。 われわれは、インビトロで正常肺線維芽細胞を病原性筋線維芽細胞に変換し、クローン異種移植片において筋線維芽細胞を活性化して動員する能力により、正常幹細胞とは区別される主要な幹細胞変異体を同定した。 この線維化促進性幹細胞変異体は、正常肺や胎児肺にも少量存在することが示されており、臓器線維化に関与する遺伝子の広範なネットワークを発現し、以前に発表されたscRNA-seq研究で特定された異常な上皮サインと遺伝子発現が重複していることが示された。 IPF。 薬物スクリーニングは、この線維化促進変異体の上皮成長因子の阻害剤に対する特異的な脆弱性と、将来の治療標的としてのラパマイシンシグナル伝達の哺乳動物標的を浮き彫りにした。 IPFにおけるこの線維化促進性幹細胞変異体は、最近同定された慢性閉塞性肺疾患における線維化促進性幹細胞変異体とは異なり、軽微な既存の幹細胞変異体の不適切な蓄積が慢性肺疾患の一因となっているという概念を拡張する可能性がある。
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特発性肺線維症( idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) )関連の学術的情報収集してシェアしています。Google Scholar SearchのUpdateを定期的に掲載しています。ChatGPTやGoogle BARDのを駆使して、自分の専門知識で一定の重み付けはしているとは思いますが、玉石混交です。
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