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Network-based identification genetic effect of SARS-CoV-2 infections to Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) patients
TA Taz, K Ahmed, BK Paul, M Kawsar… - Briefings in …, 2021 - academic.oup.com
… , idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is considered to be the most vital one [3]. As viral infections
can immensely enhance IPF … face numerous complications because of having IPF [4, 5]. …
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Network-based identification genetic effect of SARS-CoV-2 infections to Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) patients
Abstract
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is accountable for the cause of coronavirus disease (COVID-19) that causes a major threat to humanity. As the spread of the virus is probably getting out of control on every day, the epidemic is now crossing the most dreadful phase. Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a risk factor for COVID-19 as patients with long-term lung injuries are more likely to suffer in the severity of the infection. Transcriptomic analyses of SARS-CoV-2 infection and IPF patients in lung epithelium cell datasets were selected to identify the synergistic effect of SARS-CoV-2 to IPF patients. Common genes were identified to find shared pathways and drug targets for IPF patients with COVID-19 infections. Using several enterprising Bioinformatics tools, protein-protein interactions (PPIs) network was designed. Hub genes and essential modules were detected based on the PPIs network. TF-genes and miRNA interaction with common differentially expressed genes and the activity of TFs are also identified. Functional analysis was performed using gene ontology terms and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway and found some shared associations that may cause the increased mortality of IPF patients for the SARS-CoV-2 infections. Drug molecules for the IPF were also suggested for the SARS-CoV-2 infections. -
特発性肺線維症（IPF）患者に対するSARS-CoV-2感染のネットワークベースの同定遺伝的影響
概要
重症急性呼吸器症候群コロナウイルス 2 (SARS-CoV-2) は、人類に大きな脅威をもたらすコロナウイルス病 (COVID-19) の原因となっています。 ウイルスの拡散はおそらく毎日のように制御不能になっているため、流行は現在最も恐ろしい段階を経ています。 特発性肺線維症 (IPF) は、COVID-19 の危険因子です。長期の肺損傷を負った患者は感染の重症度に苦しむ可能性が高いからです。 IPF 患者に対する SARS-CoV-2 の相乗効果を特定するために、肺上皮細胞データセットにおける SARS-CoV-2 感染および IPF 患者のトランスクリプトーム解析が選択されました。 COVID-19 感染症の IPF 患者に共通の経路と薬物標的を見つけるために、共通の遺伝子が特定されました。 いくつかの進取的なバイオインフォマティクス ツールを使用して、タンパク質間相互作用 (PPIs) ネットワークが設計されました。 ハブ遺伝子と必須モジュールは、PPI ネットワークに基づいて検出されました。 TF 遺伝子および miRNA と共通の発現差のある遺伝子との相互作用、および TF の活性も特定されます。 機能分析は、遺伝子オントロジーの用語と遺伝子とゲノムの京都百科事典経路を使用して実行され、SARS-CoV-2感染によるIPF患者の死亡率の増加を引き起こす可能性のあるいくつかの共通の関連性が見つかりました. IPF の薬物分子は、SARS-CoV-2 感染についても示唆されました。
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特発性肺線維症( idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) )関連の学術的情報収集してシェアしています。Google Scholar SearchのUpdateを定期的に掲載しています。GoogleのAIが一定の重み付けはしているとは思いますが、玉石混交です。
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昼前にリハビリのため散歩に出掛けているのだが、どうも足が重たい。酸素チューブを数分外すとSpO2がすぐに90％を割ってしまう。日中、体が重い。。。あまり良い傾向ではないな〜。
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癒しの音楽をお届けいたします。
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